要鑑定螯蝦的性別,最準確的方法是看看牠們位於底部的生殖器,對於大部份螯蝦如Cambarus Procambarus 和迷螯Cambarellus等品種都能在第四、五對步足之間找到明顯的性徵,雄性在泳足上排有一對輸送精子的交尾器Gonopod,而雌性則有一個接收精子的儲精囊annulus ventrials(sperm receptacle),基本上從兩者之間明顯的性徵便能輕易分別出螯蝦的性別。但對於像Cherax屬的品種卻較難分別,雄性的的交尾器長在第五對步足近身體的部位,程現兩處凸起的小鉤狀,至於雌性則在第三重對步足近身體的部位有兩處程圖形的小孔就是生殖孔Gonoporen。對於太小的螯蝦幼體來說,不論任何品種,由於性徵還未明顯,單靠肉眼是無法準確分別的,而成體我們往往能從牠們的鉗形大小和尾部的寬度分別得到。
Cambarellus 屬迷你種螯蝦的性別鑑定
Charex屬螯蝦的性別鑑定